飲料灌裝系統需要定期的徹底清洗。清洗藥劑可以清除附着在系統中的污垢，如天然有機物和礦物沉澱。

　　雖然CIP不經常使用，但仍然需要全自動設計，具有較高的除菌級别。CIP過濾器用來移除雜質，保護飲料系統。